Багряник японский – кустарник или дерево высотой до 30 м в собсивенном ареале обитания и 5-7 метров на територии России. С мощной широкой кроной пирамидальной формы и несколькими стволами, формирующимися у самого основания. Кора стволов в зрелом возрасте темно-серая, трещиноватая. Молодые побеги коричневые, голые, с течением времени приобретают серовато-коричневую окраску. Корневая система мощная, стержневая, многочисленные корни располагаются у поверхности почвы.